主被动海洋光学遥感融合反演技术与示范，科技部国家重点研发计划，461万，2016年-2020年，主持；

海洋生态系统储碳过程的多尺度调控及其对全球变化的响应，科技部国家重点研发计划全球变化应对，95万，2016年-2021年，课题参与；

SBA系统自阴影效应及其校正方法研究，国家自然科学基金委面上项目，64万，2018年-2021年，主持；

水色水温仪COCTS（紫外成像仪UVI）的水色各要素和海表温度反演，统计产品开发，赤潮识别算法和代码开发，55万，2018年，主持；

基于类群分辨的海洋浮游植物固碳遥感机理与方法研究，国家自然科学基金委重点项目，306万，2019年-2023年，主持；

哨兵二号横向课题，370万，2021年-2021年，主持；

海丝二号横向课题，830万，2022年-2023年，主持；

Identification and quantification of primary phytoplankton functional types in the global oceans from hyperspectral ocean color remote sensing，国家自然科学基金委-外国学者研究基金项目，160万，2023-2024年，主持；

星载海洋激光雷达海洋应用算法，109.2万，2022-2025年，科技部国家重点研发计划，课题参与；

高一致性多源水色卫星数据融合技术研究，230万，2024-2029年，国家自然科学基金委-重点项目，主持；

海气热量交换的关键海洋过程及其参数化，136万，2024-2029年，国家重点研发计划，课题参与；

2019年，获得“美国光学学会Fellow”

2022年，受聘为厦门大学“唐世凤”海洋学科讲席教授

2024年，入选爱思唯尔（Elsevier）中国高被引学者（Highly Cited Chinese Researchers）榜单

2025年，入选斯坦福大学（Stanford University）和国际权威学术出版社爱思唯尔（Elsevier）共同发布2025年全球前2%顶尖科学家榜单（World's Top 2% Scientists）。

厦门大学光学海洋学实验室（英文：Optical Oceanography Laboratory，简称OOL），隶属厦门大学海洋生物地球化学全国重点实验室（英文：State Key Laboratory of Marine Environmental Science，简称MEL）。实验室团队是由李忠平教授、商少凌教授、上官明佳副教授、张彩云副教授、余小龙副教授以及工程师、科研助理、博士、硕士等六十余人组成的科研团队。李忠平教授、商少凌教授已有超过20年的海洋光学、水色遥感背景，在辐射传输模型、遥感算法、现场测量方法及遥感产品在海洋及环境等方面的应用都有开创性的工作成果。上官明佳副教授具有近10年激光雷达科研经历，研制及参与研制了10类国际先进、国内领先的激光雷达，在中高层激光雷达、基于量子和超导的激光雷达、气体激光雷达等领域作出了重要贡献。余小龙副教授具有近10年水色遥感研究经历，在水体浊度、海表反照率、固有光学特性等参数的遥感估算方面发表了诸多原创性成果。张彩云副教授主要研究方向为海洋遥感应用，海洋生态系统与物理过程的耦合作用及其对气候变化的响应。